Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN4Q9NQC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN4Q9NQC3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms