Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FZD3Q9NPG1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD3Q9NPG1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD3Q9NPG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms