Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA8Q9NP80 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms