Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms