Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC4Q9HBW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC4Q9HBW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms