Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF408Q9H9D4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF408Q9H9D4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms