Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms