Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM12Q9H4Q4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM12Q9H4Q4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.9 ms