Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCAD1Q9H4L7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCAD1Q9H4L7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms