Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4BQ9H444 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4BQ9H444 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms