Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX5Q9H2C1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX5Q9H2C1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms