Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP44Q9H0E7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP44Q9H0E7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms