Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA4Q9GZZ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms