Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCOLN1Q9GZU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCOLN1Q9GZU1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms