Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP44Q9C0F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms