Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4CQ9C0C4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4CQ9C0C4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms