Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD2Q9BZL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD2Q9BZL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms