Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms