Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP3Q9BWW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms