Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM106CQ9BVX2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM106CQ9BVX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms