Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIOK2Q9BVS4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIOK2Q9BVS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIOK2Q9BVS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms