Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB2BQ9BVA1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms