Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RSG1Q9BU20 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RSG1Q9BU20 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms