Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CPPED1Q9BRF8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPPED1Q9BRF8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms