Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF2Q9BQY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHOXF2Q9BQY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms