Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LPIN3Q9BQK8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPIN3Q9BQK8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms