Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF25Q9BQ70 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms