Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX50Q9BQ39 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX50Q9BQ39 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms