Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRTNQ99748 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRTNQ99748 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRTNQ99748 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRTNQ99748 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRTNQ99748 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NRTNQ99748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms