Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3Q99687 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3Q99687 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3Q99687 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3Q99687 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MEIS3Q99687 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms