Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP4Q99569 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP4Q99569 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PKP4Q99569 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP4Q99569 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP4Q99569 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP4Q99569 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP4Q99569 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP4Q99569 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP4Q99569 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP4Q99569 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP4Q99569 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP4Q99569 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP4Q99569 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP4Q99569 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms