Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT12Q99456 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms