Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCF12Q99081 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms