Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN3Q96TC7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms