Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms