Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms