Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HHIPQ96QV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHIPQ96QV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HHIPQ96QV1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms