Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNGAP1Q96PV0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms