Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms