Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NLRP3Q96P20 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms