Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP3Q96KP6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms