Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms