Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCHS1Q96JQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms