Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDHR1Q96JP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR1Q96JP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms