Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF479Q96JC4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms