Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF6Q96J87 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF6Q96J87 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms