Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms