Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC97Q96F63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms