Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGF29Q96ES7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms