Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD3Q96ES6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms